Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RaraP11416 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RaraP11416 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RaraP11416 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RaraP11416 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RaraP11416 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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