Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd4P10628 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms