Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P10404 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P10404 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
P10404 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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