Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atf6bO35451 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atf6bO35451 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms