Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
ColqO35348 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
ColqO35348 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
ColqO35348 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms