Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20834J3QM72 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20834J3QM72 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms