Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm6594J3QM43 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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