Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmem200cJ3QK46 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms