Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NpcdF8VQB8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NpcdF8VQB8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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