Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ScaperF8VQ70 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms