Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms