Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syde2E9PUP1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syde2E9PUP1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms