Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Phf11cB4XVP9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Phf11cB4XVP9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Phf11cB4XVP9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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