Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rrn3B2RS91 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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