Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atp8b5A3FIN4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atp8b5A3FIN4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Atp8b5A3FIN4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Atp8b5A3FIN4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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