Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Scn3aA2ASI5 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Scn3aA2ASI5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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