Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd3Q9Z2D8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms