Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ercc4Q9QZD4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ercc4Q9QZD4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ercc4Q9QZD4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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