Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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FancaQ9JL70 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FancaQ9JL70 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms