Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ldb3Q9JKS4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms