Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn23Q9D7D7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms