Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 971.3 ms