Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrameQ9D4Z5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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