Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snrnp35Q9D384 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms