Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cnot11Q9CWN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms