Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nudt21Q9CQF3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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