Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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