Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gdpd3Q99LY2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms