Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim11aQ99J19 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Smim11aQ99J19 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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