Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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