Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms