Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms