Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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