Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms