Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sys1Q78S06 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 227.5 ms