Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrimpolQ6P1E7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrimpolQ6P1E7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms