Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrn1Q61809 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrn1Q61809 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrn1Q61809 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrn1Q61809 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms