Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TmpoQ61033 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TmpoQ61033 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms