Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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