Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DbpQ60925 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms