Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc9Q3V038 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ttc9Q3V038 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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