Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BB287469Q3UT53 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms