Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms