Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Skap2Q3UND0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Skap2Q3UND0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms