Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp19Q3UJD6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms