Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nkx6-3Q3UHX8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Nkx6-3Q3UHX8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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