Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Hip1-210ENSMUST00000212301 1625 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rnf166Q3U9F6 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms