Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms