Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Srsf6Q3TWW8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms