Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms